Колледж был создан в 1997 году как Сургутское отделение Шадринского финансово-экономического колледжа. В соответствии с приказом Министерства финансов Российской Федерации от 14 июля 1992 года № 82 Сургутское отделение преобразовано в Сургутский филиал государственного образовательного учреждения среднего профессионального образования «Шадринский финансово-экономический колледж».

Распоряжением Правительства Российской Федерации от 19 апреля 2005 г. № 440-р Государственное образовательное учреждение среднего профессионального образования «Шадринский финансово-экономический колледж» был присоединен к федеральному  государственному образовательному учреждению высшего профессионального образования «Академия бюджета и казначейства Министерства финансов Российской Федерации» в качестве филиала. Приказом Министерства финансов Российской Федерации от 14 июля 2005 г. № 92н создан Сургутский финансово-экономический колледж - филиал федерального  государственного образовательного учреждениия высшего профессионального образования «Академия бюджета и казначейства Министерства финансов Российской Федерации».

Переименован приказом Министерства финансов Российской Федерации № 199 от 31.01.2011 г.  в Сургутский финансово-экономический колледж - филиал федерального государственного образовательного бюджетного учреждения высшего профессионального образования "Государственный университет Министерства финансов Российской Федерации"

Сургутский финансово-экономический колледж  организован  в целях реализации образовательных программ среднего профессионального образования, дополнительного профессионального образования.